Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms