Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDR2Q01850 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms