Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms