Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms