Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RPS29P62273 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms