Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms