Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX1P48742 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms