Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms