Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms