Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms