Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA11P31270 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms