Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms