Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms