Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFE3P19532 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TFE3P19532 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms