Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAV1P15498 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VAV1P15498 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms