Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG2P13727 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms