Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUP10909 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms