Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms