Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms