Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRB1P04280 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms