Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms