Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms