Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms