Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms