Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms