Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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