Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms