Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DXG7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DXG7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DXG7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DXG7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms