Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms