Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.5 ms