Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms