Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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