Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.2 ms