Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms