Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms