Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms