Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms