Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms