Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms