Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms