Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms