Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms