Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms