Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms