Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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