Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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