Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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