Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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EEA1Q15075 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
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