Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD11Q14690 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms