Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGA9Q13797 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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